Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms