Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms