Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms