Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms