Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL23P55773 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL23P55773 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL23P55773 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL23P55773 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL23P55773 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL23P55773 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL23P55773 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL23P55773 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL23P55773 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms