Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMTNP53814 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms