Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms