Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TGM4P49221 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TGM4P49221 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM4P49221 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms