Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXNP49023 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXNP49023 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXNP49023 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXNP49023 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXNP49023 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXNP49023 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXNP49023 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXNP49023 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXNP49023 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXNP49023 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXNP49023 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms