Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNNT2P45379 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT2P45379 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms