Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms