Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD52P43351 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD52P43351 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD52P43351 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms