Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms