Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACVR1BP36896 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACVR1BP36896 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms