Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms