Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL3P36405 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL3P36405 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL3P36405 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL3P36405 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms