Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4AP35499 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms