Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6P35125 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP6P35125 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP6P35125 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP6P35125 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP6P35125 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP6P35125 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP6P35125 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP6P35125 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP6P35125 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP6P35125 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP6P35125 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP6P35125 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP6P35125 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP6P35125 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms