Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIITAP33076 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIITAP33076 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIITAP33076 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIITAP33076 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms