Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms