Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms