Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD1P28340 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD1P28340 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD1P28340 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD1P28340 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD1P28340 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD1P28340 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms