Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms