Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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