Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms