Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms