Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPI1P17947 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms