Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DESP17661 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DESP17661 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DESP17661 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DESP17661 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms