Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms