Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms