Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms