Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP2CP0DJJ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms