Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms