Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms