Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms