Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms