Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAP2AP05549 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms