Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD3O95983 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms