Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms