Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLO75128 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLO75128 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLO75128 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLO75128 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLO75128 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLO75128 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms