Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4BP1O75113 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms