Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SLC25A20O43772 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SLC25A20O43772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms