Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNQ3O43525 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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