Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms