Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 25.8□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 55.75□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 55.65□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 25.6□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.058e-10■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 YTHDC1-206ENST00000510746 515 ntTSL 422.99■■□□□ 1.273e-10■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.573e-8■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-8■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 324.03■■□□□ 1.441e-17■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -13e-9■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.273e-9■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 56.55□□□□□ -1.363e-9■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.371e-16■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-16■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 MROH1-204ENST00000527071 680 ntTSL 312.15□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 224.17■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.95e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-203ENST00000571291 927 ntTSL 318.37■□□□□ 0.535e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-209ENST00000573520 787 ntTSL 316.21■□□□□ 0.195e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-214ENST00000575002 562 ntTSL 415.39■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 NMRAL1-216ENST00000575995 413 ntTSL 313.64□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 20.2
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PRPF4O43172 NMRAL1-211ENST00000573571 731 ntTSL 312.37□□□□□ -0.435e-6■■■■□ 20.2
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PRPF4O43172 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-8■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 LEMD1-211ENST00000629624 576 ntTSL 410.6□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 LEMD1-209ENST00000625854 516 ntTSL 48.41□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 20.2
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PRPF4O43172 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 INTS1-207ENST00000493531 828 ntTSL 314.98□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.2
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PRPF4O43172 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-23■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.797e-12■■■■□ 20.2
PRPF4O43172 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 521.17■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 20.2
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PRPF4O43172 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-22■■■■□ 20.1
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PRPF4O43172 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 20.1
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PRPF4O43172 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.624e-10■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-10■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-10■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.446e-9■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 216.82■□□□□ 0.286e-9■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.936e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DDX41-202ENST00000503078 2375 ntTSL 225.97■■□□□ 1.756e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.76e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-218ENST00000540963 875 ntTSL 225.53■■□□□ 1.686e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.646e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NOP16-204ENST00000504821 544 ntTSL 524.28■■□□□ 1.486e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-206ENST00000499045 505 ntTSL 223.99■■□□□ 1.436e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PRKD2-207ENST00000597088 855 ntTSL 223.03■■□□□ 1.286e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.236e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INAVA-203ENST00000451872 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.27■■□□□ 1.166e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.136e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-215ENST00000537551 596 ntTSL 222.12■■□□□ 1.136e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CCDC137-206ENST00000575223 1888 ntTSL 522.03■■□□□ 1.125e-6■■■■□ 20.1
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