Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF6O14896 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF6O14896 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF6O14896 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF6O14896 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF6O14896 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF6O14896 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms