Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms