Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BQV1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BQV1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BQV1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BQV1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BQV1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BQV1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BQV1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BQV1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BQV1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms