Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-1B6SEH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms