Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DEV8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DEV8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
B4DEV8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
B4DEV8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
B4DEV8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
B4DEV8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
B4DEV8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B4DEV8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms